莱茵城宝箱主要分布在黑街、下水道-蓄水池、下水道-排污口等区域，共8个宝箱。黑街地图二楼右上角的狭长小平台有一个宝箱，楼梯后方中间偏左位置藏着第二个。这两个宝箱需要仔细探索角落，部分位置需攀爬或绕行才能到达。
下水道-蓄水池区域集中了4个宝箱：中间偏下位置、蓄水池墙上、进门右转处以及中间偏右区域。其中蓄水池墙上的宝箱在主线剧情动画中出现过，相对显眼，其余三个需要沿墙体边缘移动或穿过狭窄通道才能发现。该区域敌人较多，但获取宝箱无需清怪。
一个关键宝箱位于废液倾倒处，需触发特殊机关才能开启。此处有四条巨型管道和四个闸口，需要依次转动闸口并跳跃至管道上方。该机关解法具有固定顺序，建议先清理周边敌人再操作，避免战斗干扰。
探索建议选择自由模式而非主线任务期间寻找，部分宝箱位置受剧情进度限制无法到达。黑街宝箱需注意二层栏杆的视觉死角，下水道区域建议按蓄水池→排污口的路线系统搜索。所有宝箱无需战斗即可开启，但部分位置敌人密集需规划行进路线。
