驯服翼龙的核心在于了解并准备其偏好的食物。翼龙作为肉食性飞行生物，其驯服效率与所提供的食物品质直接相关。最高效的食物是专用的饲料，例如驯服无齿翼龙效果最佳的渡渡鸟蛋饲料。在没有特制饲料的情况下，优质的生肉是次优选择，这包括了生羊肉、优质生肉以及优质生鱼肉等，它们能显著加快驯服进度。普通的生肉和熟肉虽然也能用于驯服，但所需时间会更长，效率相对较低。在计划驯服翼龙前，有针对性地收集高级肉类或提前制作对应饲料，是成功且快速完成驯服的关键前提。
游戏内存在多种翼龙，其食物偏好大体相似但存在细微差别，了解这些差异有助于优化驯服策略。无齿翼龙作为玩家早期最容易获得的飞行坐骑，其喜爱的食物序列已明确为渡渡鸟蛋饲料、生羊肉、优质生肉等。而像风神翼龙这类更大型、驯服难度更高的空中生物，其首选食物是霸王龙蛋饲料，其次才是优质生肉。对于古神翼龙，则推荐使用异特龙蛋饲料进行驯服。这表明，尽管各类翼龙都以肉类为基础食粮，但针对性地使用其最喜爱的特定蛋类饲料，能最大化驯服效率，减少过程中可能发生的意外风险。
成功驯服翼龙不仅依赖于食物，还涉及一套完整的流程控制。首先需要利用工具使目标翼龙失去行动能力，常用的方法包括使用流星锤将其困住，再用弹弓或麻醉箭等武器攻击直至其眩晕倒地。在翼龙昏迷期间，需将准备好的食物放入其物品栏，它会自动进食。必须密切关注其眩晕值，通过向其物品栏放入黑色浆果或麻醉药并强制使用来维持昏迷状态，防止其提前苏醒导致驯服失败。整个过程要求玩家提前备足麻醉物品和食物，并确保驯服地点周边安全，避免其他生物干扰。
完成驯服后，翼龙将成为玩家重要的空中伙伴，但需为其装备对应的鞍具才能骑乘。无齿翼龙鞍通常在玩家达到35级时解锁。骑乘翼龙可极大提升地图探索与物资运输的效率，其飞行能力允许玩家快速跨越地形障碍。在骑乘时，需要注意翼龙的耐力管理，空中冲刺会快速消耗耐力，耐力耗尽会导致迫降，这可能带来危险。
